La naranja es el cítrico de mayor producción a nivel mundial, y sus residuos, que son desechados, representan el 50% del fruto. Estos residuos causan problemas importantes de contaminación. Las cáscaras de naranja son ricas en celulosa, hemicelulosa y pectina que podrían emplearse en la producción de enzimas. En este estudio se aislaron hongos de naranjas y se identificaron por análisis de la secuencia ribosomal 5.8S rRNA-ITS como Fusarium sp. N6C6, Cladosporium oxysporum N1C1, Mucor racemosus N9C1 y Penicillium minioluteum N3C2. Estas cepas y Trichoderma reesei ATCC 26921 se utilizaron para la producción de endoglucanasas (EG), xilanasas (XYL) y poligalacturonasas (PGA) por fermentación en estado sólido utilizando cáscara de naranja. P. minioluteum N3C2 alcanzó 6.5 U/g de cáscara seca (DP), la mayor producción de EG, superando a T. reesei ATCC 26921 (3.3 U/g DP). T. reesei ATCC 26921 y P. minioluteum N3C2 tuvieron la mayor producción de XYL, con 14.7 y 14.5 U/g DP respectivamente. La mayor producción de PGA fue obtenida con Fusarium sp. N6C6 (16.5 U/g DP), seguida de M. racemosus N9C1 (12.3 U/g DP), la cual produjo menos EG. C. oxysporum N1C1 produjo EG (3.2 U/g DP) y PGA (8.0 U/g DP), pero no produjo XYL. Las cepas exploradas poseen gran potencial para la producción de enzimas que podrían utilizarse en la extracción de aceites cítricos.